Er is niet één oorzaak aan te wijzen. Het gaat om een samenloop van factoren die elkaar versterken.
Intensieve landbouw heeft geleid tot grote, uniforme velden met weinig ruimte voor bloemen en insecten. Meerdere generaties van bemesting en bestrijdingsmiddelen hebben het bodemleven verarmd en het water en de lucht vervuild.
De stikstofproblematiek speelt een grote rol. Te veel stikstof uit mest en verkeer tast kwetsbare natuurgebieden aan. Planten die snel groeien verdringen soorten die meer tijd en andere voedingsstoffen nodig hebben en zo kan een compleet ecosysteem veranderen.
Verstedelijking en infrastructuur zorgen voor versnippering van leefgebieden. Dat betekent dat dieren moeilijker kunnen trekken of zich voortplanten.
Klimaatverandering zorgt voor droge zomers, hevige buien en verschuivende seizoenen. Veel soorten kunnen zich niet snel genoeg aanpassen.